En la zona montañosa del norte morelense, se manifiesta, principalmente, un clima semifrío y hay abundancia de bosques de chichicaule, trompillo, tila, madroño, oyamel, pino y encino.
En el sur del estado lo que prevalece es la selva baja cadusifolia.Las especies más significativas de los ambientes vegetales de Morelos son el pochote, copal, ámate blanco, palo dulce, huaje, casahuate y tepehuaje.
Por lo que se refiere a los animales más representativos de los parajes montañosos de Morelos, sobresalen los venados cola blanca, coyotes, lobos, tejones, conejos, ardillas, tlacuaches, zorros y víboras.En cambio, al sur de esta entidad, pueden hallarse tejones, zorras, armadillos, tlacuaches, conejos, ratones, culebras, aves y una asombrosa diversidad de insectos.